Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1Q9JIT0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1Q9JIT0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmbr1Q9JIT0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmbr1Q9JIT0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmbr1Q9JIT0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms