Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ercc6l2Q9JIM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ercc6l2Q9JIM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ercc6l2Q9JIM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ercc6l2Q9JIM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ercc6l2Q9JIM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms