Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccl28Q9JIL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl28Q9JIL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl28Q9JIL2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms