Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup50Q9JIH2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup50Q9JIH2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup50Q9JIH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup50Q9JIH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms