Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lgi1Q9JIA1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgi1Q9JIA1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgi1Q9JIA1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lgi1Q9JIA1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lgi1Q9JIA1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms