Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn2Q9JI91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Actn2Q9JI91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Actn2Q9JI91 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn2Q9JI91 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms