Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EefsecQ9JHW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EefsecQ9JHW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EefsecQ9JHW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EefsecQ9JHW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EefsecQ9JHW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms