Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tcirg1Q9JHF5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcirg1Q9JHF5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcirg1Q9JHF5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcirg1Q9JHF5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcirg1Q9JHF5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms