Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
Rb1cc1Q9ESK9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Rb1cc1Q9ESK9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Rb1cc1Q9ESK9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Rb1cc1Q9ESK9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Rb1cc1Q9ESK9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
Rb1cc1Q9ESK9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms