Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES90

Gpr35, G-protein coupled receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr35Q9ES90 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr35Q9ES90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpr35Q9ES90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpr35Q9ES90 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpr35Q9ES90 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms