Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ripk4Q9ERK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ripk4Q9ERK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ripk4Q9ERK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ripk4Q9ERK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ripk4Q9ERK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ripk4Q9ERK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272 ms