Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn12Q9ER56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn12Q9ER56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn12Q9ER56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn12Q9ER56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms