Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms