Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlr1Q9EPQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr1Q9EPQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr1Q9EPQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms