Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp1aQ9EPL5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp1aQ9EPL5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp1aQ9EPL5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp1aQ9EPL5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp1aQ9EPL5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms