Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rp2Q9EPK2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rp2Q9EPK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rp2Q9EPK2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rp2Q9EPK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms