Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pop7Q9DCH2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pop7Q9DCH2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pop7Q9DCH2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pop7Q9DCH2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.7 ms