Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc46a3Q9DC26 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc46a3Q9DC26 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc46a3Q9DC26 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc46a3Q9DC26 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc46a3Q9DC26 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms