Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syde1Q9DBZ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syde1Q9DBZ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syde1Q9DBZ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syde1Q9DBZ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Syde1Q9DBZ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syde1Q9DBZ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms