Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Xrn2Q9DBR1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Xrn2Q9DBR1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Xrn2Q9DBR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Xrn2Q9DBR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xrn2Q9DBR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms