Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg9Q9DB90 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smg9Q9DB90 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg9Q9DB90 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg9Q9DB90 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg9Q9DB90 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms