Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn3Q9DAW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn3Q9DAW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn3Q9DAW9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms