Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actrt1Q9D9J3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actrt1Q9D9J3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Actrt1Q9D9J3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Actrt1Q9D9J3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Actrt1Q9D9J3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms