Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf3c6Q9D8P7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtf3c6Q9D8P7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.9 ms