Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D8N1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D8N1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D8N1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D8N1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D8N1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9D8N1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1057.3 ms