Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms