Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clca1Q9D7Z6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clca1Q9D7Z6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca1Q9D7Z6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca1Q9D7Z6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms