Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capns2Q9D7J7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capns2Q9D7J7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capns2Q9D7J7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capns2Q9D7J7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capns2Q9D7J7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms