Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Borcs8Q9D6Y4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Borcs8Q9D6Y4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Borcs8Q9D6Y4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Borcs8Q9D6Y4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms