Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab11fip1Q9D620 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip1Q9D620 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip1Q9D620 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip1Q9D620 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab11fip1Q9D620 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip1Q9D620 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
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