Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.9 ms