Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn11Q9D572 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn11Q9D572 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn11Q9D572 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ubxn11Q9D572 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubxn11Q9D572 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ubxn11Q9D572 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn11Q9D572 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn11Q9D572 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms