Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc130Q9D516 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc130Q9D516 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc130Q9D516 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc130Q9D516 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms