Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930556J24RikQ9D4U7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930556J24RikQ9D4U7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms