Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930578G10RikQ9D4Q4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930578G10RikQ9D4Q4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms