Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syce1Q9D495 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Syce1Q9D495 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syce1Q9D495 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syce1Q9D495 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms