Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rufy3Q9D394 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rufy3Q9D394 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rufy3Q9D394 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rufy3Q9D394 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rufy3Q9D394 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rufy3Q9D394 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy3Q9D394 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy3Q9D394 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms