Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt44Q9D2Q2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trmt44Q9D2Q2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trmt44Q9D2Q2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trmt44Q9D2Q2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trmt44Q9D2Q2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms