Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Creb3l4Q9D2A5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l4Q9D2A5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Creb3l4Q9D2A5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Creb3l4Q9D2A5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms