Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ss18l2Q9D174 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ss18l2Q9D174 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms