Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,18■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,18■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15,17■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
Mrpl52Q9D0Y8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,14■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,13■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15,13■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,13■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15,12■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15,12■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,1■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0,01
Mrpl52Q9D0Y8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,08■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15,06■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15,06■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,06■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ 0
Mrpl52Q9D0Y8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,04■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,04■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,03■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,02■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15,02■□□□□ -0
Mrpl52Q9D0Y8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,02□□□□□ -0,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,7 ms