Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndc80Q9D0F1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndc80Q9D0F1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndc80Q9D0F1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc80Q9D0F1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndc80Q9D0F1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms