Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gtf2e1Q9D0D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf2e1Q9D0D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf2e1Q9D0D5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms