Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20,06■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Cmss1Q9CZT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Cmss1Q9CZT6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,95■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19,93■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Cmss1Q9CZT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,3 ms