Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufsp1Q9CZP0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp1Q9CZP0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ufsp1Q9CZP0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms