Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl35Q9CZ49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl35Q9CZ49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl35Q9CZ49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl35Q9CZ49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl35Q9CZ49 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl35Q9CZ49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl35Q9CZ49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl35Q9CZ49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl35Q9CZ49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms