Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nsfl1cQ9CZ44 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nsfl1cQ9CZ44 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nsfl1cQ9CZ44 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nsfl1cQ9CZ44 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms