Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rex1bdQ9CYZ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rex1bdQ9CYZ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rex1bdQ9CYZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rex1bdQ9CYZ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms