Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYF5

Rcc1l, RCC1-like G exchanging factor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcc1lQ9CYF5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcc1lQ9CYF5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcc1lQ9CYF5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rcc1lQ9CYF5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcc1lQ9CYF5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcc1lQ9CYF5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rcc1lQ9CYF5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rcc1lQ9CYF5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rcc1lQ9CYF5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Rcc1lQ9CYF5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Rcc1lQ9CYF5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rcc1lQ9CYF5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rcc1lQ9CYF5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rcc1lQ9CYF5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rcc1lQ9CYF5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Rcc1lQ9CYF5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rcc1lQ9CYF5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rcc1lQ9CYF5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rcc1lQ9CYF5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rcc1lQ9CYF5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcc1lQ9CYF5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcc1lQ9CYF5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rcc1lQ9CYF5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rcc1lQ9CYF5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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