Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY73

Mrpl44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl44Q9CY73 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Mrpl44Q9CY73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Mrpl44Q9CY73 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mrpl44Q9CY73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mrpl44Q9CY73 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mrpl44Q9CY73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mrpl44Q9CY73 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mrpl44Q9CY73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms